La préfecture de Nagasaki regroupe la pointe nord-ouest du Kyushu et des centaines de petites îles. La capitale de la préfecture est la ville de Nagasaki (Nagasaki City). Autre destination touristique populaire de la préfecture : la péninsule Shimabara avec le mont Unzen au centre. À Nagasaki, les principales attractions sont le Mémorial pour la Paix, le mont Inasa, les temples Sofukuji et Kufukuji, l’église Oura, le sanctuaire confucéen Gunkanjima et l’ancien quartier Dejima (à l’époque réservé aux commerçants hollandais). Nagasaki organise également chaque année le « Nagasaki Kunchi », le festival du sanctuaire Suwa.